El objetivo de la UNJu como institución democrática es la formación de hombres y mujeres con un elevado sentido ético, como también fomentar la participación activa entre todos los miembros de la universidad. Donde no solo se busca impartir conocimientos académicos, sino que también la formación de ciudadanos conscientes y participativos en la construcción de una sociedad más justa y democrática. Sumado a esto, promover la libertad de expresión dentro de un marco de respeto y tolerancia.